Законодательная дума Томской области во втором чтении приняла решение о замене прямых выборов мэра Томска на процедуру конкурса. В инфографике «КП-Томск» можно наглядно увидеть явку на прямых выборах мэра города в предыдущие годы.
Активнее всего на выборах мэра жители Томска голосовали до 2004 года, однако последние десять лет избирательная активность стала падать. Явка на выборах в 2018 году составила всего 20,79%. Победивший на выборах Иван Кляйн (39 621 голосов) набрал меньше голосов, чем занявший второе место в 2004 году Владимир Резников (44 071 голосов).
В 1993 году первым мэром Томска стал Геннадий Коновалов, на тот момент он был назначен главой городской администрации, в 1994 его должность была переименована в мэра. В 1996 году на первых выборах мэра Коновалов проиграл главе администрации Советского района Александру Макарову. Он управлял городом 10 лет.
Выборы мэра Томска проходили в городе всего шесть раз.В 1996 и 2000 годах для выбора победителя требовался второй тур. После изменений в Уставе Томска в 2002 году порог для второго тура был снижен до 25%, а все последующие выборы проходили в один тур.
После двух сроков на посту мэра Томска в октябре 2006 года Александра Макарова арестовали по подозрению в злоупотреблении служебным положением, впоследствии он 12 лет колонии. Исполнять обязанности стал его заместитель Игорь Шатурный, а в июне 2007 года место Макарова занял Николай Николайчук, который победил на мэрских выборах в 2009 году.
В 2013 году Николаайчук оставил пост досрочно из-за противоречий городских и областных властей. Позже Николайчука осудили на 4 года условно за превышение должностных полномочий. 13 октября 2013 года на выборах мэра победил Иван Кляйн.
В 2018 году Кляйн был переизбран на второй срок, а в ноябре 2020 года градоначальника арестовали по обвинению в превышении полномочий и отстранили от должности.
С 2020 года обязанности мэра исполняет Михаил Ратнер.